Eine schnelle Google-Suche brachte mir das hier:
http://wordpress.org/plugins/custom-post-type-permalinks/
Das könnte doch genau dein Problem lösen, oder?
Bei Frank Bültge in den Kommentaren ist auch ein Ansatz zu finden, wie man den Permalink beeinflusst:
http://bueltge.de/wordpress-custom-post-type-permalinks/1194/
Gruß, Torsten